祁門縣中醫醫院自1986年建院以來，圍繞“中醫為本，質量至優，精誠服務，惠澤民眾”宗旨，堅持“以病人為中心、充分發揮中醫藥特色，做仁醫施仁術”服務理念，歷經三十余年，現已發展成為集醫療、科研、教學和中醫技術指導于一體的一所綜合性二級甲等中醫醫院，擔負著祁門及周邊地區群眾的中醫醫療、預防、保健、康復以及突發性公共衛生事件的緊急救治任務，醫療服務范圍覆蓋黟縣、石臺及江西省浮梁縣等周邊地區。
醫院占地20467.37平方米，醫療用房總面積12452.34平方米。目前醫院編制床位為180張，六個病區實際開放床位為239張，平均住院病人達到170余人，在職職工235人，高中級技術人員90余人（其中安徽省基層名中醫2人，新安醫學非遺傳人1人）。科室設置齊全，診療科室有內科、外科、婦產科、兒科、眼耳鼻喉科、皮膚科、骨傷科、針灸康復科、麻醉科、肛腸科、急診科、體檢科；醫技科室有放射科、CT室、檢驗科、胃腸鏡室、超聲心電科、腦電圖室、碎石科、病理科、輸血科、消毒供應室、藥械科；職能科室有院辦室、人事科、醫務科、科教科、護理部、院感辦、網管中心、農合辦、醫保辦、門診部、財務科；后勤保障有總務科、設備科、保衛科等。診療設施齊全、設備精良，除中心供氧及常規配置外，還配備有螺旋CT機、CR、LEEP刀、電子腸胃鏡、全自動生化、彩色多普勒、腹腔鏡等先進診療設備和系列中醫康復理療設備。
隨著醫院整體素質的提高和社會信譽的逐漸增強，以及醫保、新農合工作的順利開展，醫院服務半徑、診療范圍也逐漸擴大，科室的應急能力和處理急、危、重、疑難病人的綜合能力得到提高，并獨具中醫特色。骨傷科、針灸康復科發揮中醫特長，在頸肩腰腿痛、中風后遺癥等疾病治療上取得了明顯療效。大力推廣和開展針灸、火罐、推拿、熏蒸、中藥外敷、刮痧等中醫特色診療技術，中醫特色科室已在當地形成影響，業務量逐年增加，社會效益不斷提高。
科學的管理、可靠的技術、優質的服務，加上獨具特色的中醫藥優勢，得到了社會的普遍認可。該院是省衛生廳確定的針灸理療康復中醫特色技術推廣建設單位、安徽中醫學院新安醫學研究基地、安徽中醫藥大學第一附屬醫院和省立兒童醫院醫聯體單位。目前有全國基層名老中醫藥專家傳承工作室1個，骨傷科和針灸科是省級重點特色專科，肛腸、糖尿病是市級重點專科專病。醫院先后被評為 “骨傷特色醫院”、“愛嬰醫院”、 “二級甲等中醫醫院”、“全省示范中醫院”。先后榮獲“安徽省十佳中醫院”、“全省百家最佳優質服務單位”、“市文明窗口單位”、“省巾幗文明崗”和中華全國總工會授予“模范職工小家”等稱號，近年來多次在縣“三位一體”窗口單位年度評比中名列前茅。隨著醫院管理步入信息化、數字化、科學化，醫院綜合服務能力不斷提升，醫院將得到持續穩步發展，以滿足人民群眾日益增長健康需要。
