甘肅省第二人民醫院始建于1958年，原為蘭州鐵路局中心醫院， 2004年由蘭州鐵路局移交甘肅省政府管理。2005年原鐵道部第一勘測設計院職工醫院劃歸醫院。2006年更名為甘肅省第二人民醫院（簡稱“省二院”）。2009年，甘肅省精神衛生防治中心在醫院成立。
省二院現為省衛生廳直屬的集醫療、教學、科研、預防、保健為一體的政府舉辦的綜合三級甲等醫院, 是西北民族大學臨床教學基地，是衛生部臨床藥師培訓基地，是甘肅省醫療衛生適宜技術培訓中心，是省級緊急醫療救援分中心，是全省城鎮職工、城鎮居民和新農合定點醫院。
省二院占地面積3.5萬平方米，醫療用房建筑面積5.5萬平方米，編制床位1010張，現有職工1006人,其中衛生技術人員903人，有享受政府特殊津貼專家、省領軍人才、中青年學科帶頭人及副高以上人員150人，有中級職稱人員270人。
近年來，在省委、省政府的關心下，在省衛生廳的正確領導下，省二院按照“做精做強西醫優勢學科，發展壯大中醫藥特色，建設現代化中西醫結合精神衛生中心，堅定不移地走中西醫結合的發展之路”，狠抓質量管理，外樹良好形象，醫療技術迅猛發展，服務總量和質量不斷提升。醫院以中西醫結合，心理康復參與為主和以藥膳食療為輔的綜合治療手段，方法獨特，療效明顯，深受社會和病員的好評。
在思想道德建設方面，省二院秉承“厚德、精業、求實、創新”的精神，始終把公益性放在首位，以病人為中心，以“創先爭優”和“三好一滿意”活動為契機，團結進取，開拓創新，真抓實干，全面加強內涵建設和文化建設，先后榮獲“全國衛生系統先進集體”、“全國醫藥衛生系統創先爭優活動先進集體”、全國醫藥衛生系統創先爭優活動黨建工作品牌特色獎、全省創先爭優先進基層黨組織等榮譽稱號，成為全國綜合醫院中醫藥工作示范單位、全省創先爭優示范觀摩單位、全省衛生系統廉政風險防范試點單位。
在特色科室建設方面，省二院始終堅持精細化管理，臨床科室齊全，技術力量雄厚，醫技科室設備先進，檢查結果準確可靠。醫院共有46個臨床科室和醫技科室，有4個臨床教研室。省精神衛生臨床中心成為省級12個中心之一，急診創傷外科（骨科）中心為省級重點學科，中醫科為綜合醫院中醫藥工作示范，藥劑科為衛生部臨床藥師培訓基地。介入與腫瘤科、心內科、消化科、神經科、呼吸科、重癥醫學科、普外科、感染科、內分泌科、老年病科、血液科、風濕科、婦產科、泌尿外科、肛腸科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮膚科、兒科和腔鏡中心、影像中心、功能科、檢驗科、核醫學科、病理科等科室技術力量和服務水平在具有明顯優勢。主要設備有螺旋CT、核磁共振、數字胃腸機、血液透析機、高端四維彩超、電子內窺鏡、超聲內鏡、電子胸腔鏡、可彎曲胸腔鏡、全自動生化儀、大型數字化平板血管造影機等醫療設備。
在人才隊伍建設方面，加大對外交流與合作，積極培養和引進高技術人才。醫院與美國阿拉巴馬州州立大學建立長期合作關系，與臺灣八里療養院締結友好醫院。每年選派中青年業務骨干赴美國、英國、法國、德國、丹麥等國家和香港、臺灣地區交流學習。先后錄用博士、碩士研究生114余人，引進高技術人才16名。加大后備人才培養機制，建立了“133”人才隊伍庫。
在衛生科研教學方面，近3年共獲省、市廳級科研立項40余項，獲省、市級科技進步獎15項。醫院除承擔西北民族大學教學和實習任務外，還承擔著甘肅中醫學院、甘肅省衛生學校、蘭州市衛生學校、平涼醫專、張掖醫專、蘭州城市學院、甘肅國防教育學院等院校的教學實習任務。
回眸昨日，省二院歷經五十載，曾經鑄就輝煌。品味今朝，醫院奮進的旋律依然鏗鏘。憧憬未來，院領導班子志存高遠，美好藍圖業已繪就。堅信在省委、省政府的關心下，在省衛生廳的正確領導下，省二院全體人員將團結一心，奮發有為，為建設政府滿意、百姓放心、職工幸福的醫院而努力奮斗，省二院也將迎來全面發展的新突破、新跨越、新騰飛。
