藥物治療是當前的常見方法，特別是細菌性的前列腺炎。由于治療前列腺炎的藥物比較多，而前列腺炎藥物的選擇往往是根據患者的病因、病情、身體癥狀而定，盲目或不規范的用藥非但對疾病康復沒有任何幫助，甚至還會造成危害。從治療上講，往往是最適合前列腺炎的藥物往往是最好的藥物。有些藥物雖然好，但是并不適合前列腺炎患者的病情，所以其治療上效果也往往不盡人意。